複数のプロジェクトで参照する共通的な別プロジェクトがあり、そちらの成果が関連づいているケースがよくあります。また、サポートが入り口となった不具合報告や要望チケットと、対象プロジェクトが関連づくことも。
例）サポート受付プロジェクト ＞ アプリケーションプロジェクト ＞ 共通ライブラリプロジェクト（他、インフラプロジェクト、品質管理プロジェクト、リリースTODOプロジェクト などなど）
親子でなくても良いのですが、プロジェクトをまたいで課題を紐付けられないことが使いづらいなぁと感じています。リポジトリもプロジェクトが別になるとプルリクで課題が紐付けられませんし。
ご検討くだされば幸いです。よろしくおねがいします。